マネージドサーバでは、1IPアドレスからの接続数に制限を設けております。この制限により、エラーが発生しているおそれがあります。また、クライアントソフトの仕様で、複数の接続をはっている可能性もあります。一度別のFTPクライアントソフトでお試しいただけませんでしょうか。