サーバ内でIMAP、POPの利用者が混在されていても使用に問題はございません。
なお、同一メールユーザでIMAPとPOPを併用する場合、POPのメール設定で 「サーバにメッセージのコピーを置く」設定を行わないと、POP受信時にサーバから メールが削除されてしまい、IMAPでは確認できない状態になってしまいますので、ご注意が必要です。
また、IMAPの場合、サーバにメールが残り続けますので、サーバの空き容量は定期的にご確認をお願いいたします。
メールソフト毎の設定については、以下ユーザサポートサイトをご参照いただければ幸いです。
■メールソフトの設定情報